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野生菌三维识别技术构建海量数字标本库

时间:2026-06-01 11:09
中国科学院昆明植物研究所发布中国西南地区大型真菌资源数据库与云南野生菌子实体三维形态数据库,前者整合8648条物种与标本数据及超2 8万张照片,后者收录423个高精度三维模型,实现野生菌数字化永久保存与精准识别,降低毒蘑菇误食风险。

吃菌子怕中毒?采菌子怕认错?这些担忧背后其实是一个数据难题——野生菌形态难以保存、数据分散零乱,传统的文字描述又容易引发理解偏差。尽管全球真菌数据库体量庞大,但对我国西南地区的针对性不足,导致毒蘑菇误食风险长期居高不下。

5月29日,中国科学院昆明植物研究所完成了一项重要举措:依托云南丰富的真菌资源与数十年的科研积累,正式发布了两大数据库——中国西南地区大型真菌资源数据库与云南野生菌子实体三维形态数据库。简单来说,就是利用数字化技术为野生菌建立“数字身份证”与立体模型,让这些高原珍稀物种突破时间与空间限制,实现永久、可共享的保存与利用。


三代人深耕,西南野生菌数据实现精准共享

云南被誉为“野生食用菌王国”绝非虚名——全省拥有900余种野生食用菌,占全球种类的30%、全国总量的90%,年市场份额更是高达全国的70%。松茸、鸡枞、干巴菌、见手青……每一种都是享誉市场的知名品种,整条产业链带动了超过10万人就业。

然而,硬币的另一面是,因形态相似而导致的误食中毒事件频频发生。传统记录方式依赖文字描述、干制标本与平面照片,无法完整保留真菌的立体形态,导致大量三维信息流失,科研与科普工作均受到限制。

“全球真菌数据库覆盖面虽然广泛,但对我国西南地区的针对性明显不足。我们整合了三代人、数十年的科研数据,建成这个专属平台,目的只有一个:把西南真菌的‘家底’彻底摸清、妥善保存并高效利用。”著名真菌学家、昆明植物研究所研究员杨祝良的这番话,道出了整个团队的心声。


据昆明植物研究所副所长牛洋研究员介绍,此次上线的中国西南地区大型真菌资源数据库,凝聚了三代科学家数十年的研究心血。该平台将野外调查、标本信息、图像数据、DNA序列等多源数据整合为一体,构建了集标准化存储、规范化管理、可视化检索于一体的综合数据平台。目前,系统已累计收录真菌物种与标本数据8648条,关联DNA序列8648条,子实体照片超过2.8万张,几乎涵盖了西南地区大型真菌的全部类群。

这一平台聚焦西南区域,打造了“名录—图片—分布”一体化的高效检索体系。其中不仅包含可食用与药用真菌的详细名录,还清晰标注了有毒真菌的相关信息,并设有标本采集热点图、物种系统发育树等特色功能模块。用户只需输入DNA序列即可进行精准比对鉴定,有效区分外观相似的物种,从根源上降低误食风险。

“数据库中每份标本都关联了物种描述、地理分布及DNA条形码,既能服务于科研工作,也能助力公众科普。我们每年还会更新毒蘑菇预防信息,为中毒鉴定提供可靠支撑。”杨祝良特别强调,这不仅是科研成果的数字化沉淀,更是生态文明建设的重要实践,为真菌资源的保护与可持续利用奠定了坚实的数据基础。


立体复刻,野生菌有了专属“数字孪生”

如果说资源数据库是西南真菌的“信息档案库”,那么云南野生菌子实体三维形态数据库则直接打造了一座可交互的“立体博物馆”。

“传统记录方式下,蘑菇采摘后极易变形,平面照片的拍摄角度有限,菌盖、菌褶、菌柄的精细结构往往无法完整呈现。三维建模技术恰好解决了这一长期难题。”牛洋表示,这个耗时一年建成的数据库,目前已收录423个高质量真菌三维模型,覆盖66科182种常见大型真菌,其中包含44种昆明地区的可食药用菌,伞菌、牛肝菌、块菌、珊瑚菌等12类典型形态一应俱全。

“依托自主研发的采集设备,5到10分钟就能完成一朵真菌的360度影像采集,重建模型的空间精度达到0.05毫米,与实物测量结果高度一致,实现了蘑菇形态的高保真复刻。”昆明植物研究所信息中心主任、高级工程师庄会富介绍时,语气中透着自信与专业。

打开平台,点击见白牛肝菌的三维模型,用户可以随意旋转、缩放查看,菌盖纹理、菌管排列、菌柄内部结构全都清晰可见。还能在线测量尺寸,甚至申请下载数据用于三维打印。搜索见手青,不同种类之间的形态差异一目了然,再也不用对着平面图片凭空猜测。平台还设置了食用、药用、有毒等分类检索功能,适配手机端浏览,扫码即可查看模型,野外快速识别从此不再困难。


“三维模型就像给蘑菇建了‘数字孪生’,能够永久保存其真实形态。”庄会富说,这个数据库不仅帮助公众精准识别菌类、远离毒蘑菇危害,还为科研开辟了全新路径——模型数据可以支撑真菌形态演化模拟、人工智能识别模型训练,推动真菌学从经验驱动向数据驱动转型。

值得关注的是,这两大数据库即将实现数据互通,形成“基础信息+立体形态”的完整展示链条。未来,昆明植物研究所将持续扩充数据,将采集范围扩展到西南乃至全国更多地区,同时攻克毛状、透明真菌的建模难题,完善移动端适配与虚拟现实浏览功能,最终形成可推广的真菌三维重建标准,推动我国真菌数字化建设再上新台阶。

来源:https://www.163.com/dy/article/KUB0AJKK0514R9OJ.html
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