六代之中除了脍炙人口的桃园三结义、十八路诸侯共抗董贼、孔明舌战江东群儒、赔了夫人又折兵等经典情节外，如杨修一合酥之辩、邓艾凤兮之对等趣闻轶事，也都通过全新的剧情系统得以完美呈现。除此之外，还另增加了不少全新的原创剧情。从仅见于杂记野史的神兵名驹，各据山头的盗贼流寇以及自设武将才能触发的特殊事件等各种故事中，玩家都拥有足够的自主控制权。

如果刘备于白门楼相救吕布，是否能降服这三国第一猛将？如果孙权断然拒绝周瑜嫁妹之计，天下又当如何三分？玩家通过亲身体验三国时代的故事，自主掌控历史的脉搏，六代在剧情上的突破可谓是一大亮点。

当然，除此之外，原本系统的进一步推陈出新也在情理之中。这次的《三国群英传Ⅵ》中，新增了革命性的"冲阵"系统，玩家可施展军师技，预先将编制外的冲阵队派遣至战场，协同本军作战，同时还可以透过视觉化的冲阵布置图，自由安排各冲阵队的队形阵列。

另一方面，三代中为玩家啧啧称道的自创武将系统正式加入了选择自定义肖像的功能，同时还可自主调整武将的武力、智力以及技能兵种等其他特性，玩家能够由此创造出更为真实的虚拟人物。

同时，《三国群英传》系列中每年都举办一次的比武大会也有了新的突破。当游戏进行一段时间后，只要玩家在比武大会中获得优胜，就有机会进行额外的高难度挑战赛，抢夺极度稀有的高级宝物。喜爱挑战极限的玩家可以通过这次附加赛扬名立万，成就伟业。

有意思的是，本作对于坐骑的强化褒贬不一，除了赤兔马、的卢、爪黄飞电等神驹外，绝影、紫骍、惊帆等名马的加盟也使得战局发生较大的转变。六代中所诠释的“一骑当千”令玩家朋友有人欢喜有人忧，可总而言之，六代结合了1.3代的官职制,丰富了2代的华丽技能画面，修改了3代的事件频率，完善了4代的地图模式，精进了5代的必杀技和士兵升级，这种锐意进取的精神也是本系列不断创出新销售佳绩的重要原因。