故事与1代为平行剧情，设定为“假设制作人晚了半年进入765Pro”，众偶像在半年内形象和身材都有了一定的变化，前作《偶像大师SP》的敌手偶像我那霸响、四条贵音正式成为可培育偶像

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。前作《偶像大师SP》中兼任业务员的秋月律子独立成为玩家的对手制作人，组建了由水濑伊织、三浦梓、双海亚美为队员的组合“龙宫小町”，虽不可在剧情中培育，但可以经过完成一定剧情后在Live For You模式下使用。同时765Pro的对手—961Pro组建了男性偶像组合“Jupiter”与玩家竞争，这个剧情设定在玩家的眼里褒贬不一。
游戏中新增了单曲排行榜模式和地区模式，偶像的Fans数量及关注度在日本六个地区（北海道—东北、关东、中部、近畿、中国—四国、九州—冲绳）有不同的显示，获得各地的排行榜第一并打败当地的王级歌手之后即可获得该地区的王者称号。此外，随着你的表现，你的单曲排行也会逐渐上升，到最后的总决战打败Jupiter取得最后的胜利。