《空中冲突：秘密战争》是一款动感十足的空战模拟游戏，玩家将通过7个背景设定在第二次世界大战期间的激动人心的战役、将近50个不同的任务，驾驶当时的16种真实再现的飞机进行战斗，从争夺制空权到轰炸地面目标，从袭击敌机群到护卫和巡逻飞行。每次任务成功后，玩家可以各项级他们的技能以便更娴熟地控制飞机，或者增强飞机的生存能力，选择更好的飞行员。战斗机有2种控制模式：街机模式的控制相对简单，模拟模式则提供了一种忠于现实的控制系统。除了单人战役，《空中冲突：秘密战争》也有7种多人游戏模式，最多支持8位玩家，通过局域网或互联网进行对战。