Hermes Agent 是一款完全在本地运行的智能学术助手，能够高效完成 PDF 文档解析、文献综述自动生成、实验数据清洗合并以及参考文献格式规范化处理。全程无需联网、不上传任何数据，保障科研资料的隐私安全。支持命令行操作与自然语言指令，最终输出可直接编辑的 LaTeX 内容，极大提升学术写作效率。

假设你需要在三天内完成一篇跨学科综述的初稿，手头有 27 篇 PDF 文献尚未精读，参考文献格式杂乱无章，实验数据分散在三个命名各异的 Excel 文件中——Hermes Agent 能够直接加载本地文件、自动提取关键结论、统一引用样式、对齐数据表头，并生成可编辑的 LaTeX 段落。整个过程严格在本地执行，绝不将任何内容上传至云端，确保数据安全与隐私保护。

将 PDF 论文导入 Hermes Agent 进行结构化解析

打开终端，进入存放所有 PDF 的目录，例如 ~/papers/llm-quantization/。

执行命令：hermes run --skill pdf-analyze --input "*.pdf"。该命令将批量触发 PDF 解析流程，自动跳过扫描版（OCR 未启用时）和加密 PDF，并在终端中显示每篇文献的解析状态。

解析失败的文件会被单独记录在 【~/.hermes/logs/pdf-failures-20260603.log】 中，包含具体错误码与页码定位建议，方便你手动修复后重新解析。

成功解析的元数据（标题、作者、DOI、方法章节摘要、图表编号列表）全部存入本地 SQLite 数据库。后续所有提问均基于这个结构化快照，无需实时重读 PDF，显著提升查询响应速度。

让 Agent 自动撰写文献综述段落

在 CLI 中输入：“对比这 27 篇论文中关于 W4A8 量化方案的硬件部署瓶颈，按 FPGA、ASIC、SoC 三类平台分别总结，要求每点附带原文页码引用。”

Agent 会自动检索已解析的 PDF 内容，定位“W4A8”“FPGA”等关键词共现段落，过滤掉仅提及而无深入分析的句子，从方法描述与实验讨论中抽取实质性结论。

生成的段落末尾自动附带引用标记，例如 [12, p.8]，对应原始 PDF 的文件名序号与实际页码，【不依赖 DOI 或 arXiv ID 反查，避免网络波动导致引用断裂】。

若某篇 PDF 未能成功解析，Agent 会跳过该文献并标注“（缺原文支撑）”，绝不会凭空编造内容，保证综述的可信度。

使用自然语言指令清洗与合并实验数据

方法一：直接拖拽合并
将三个 Excel 文件（data_v1.xlsx、exp_results_final_202605.xlsx、raw_benchmarks.csv）全选后拖入 Hermes 终端窗口并松开。此操作极为简便，直接拖入文件即可完成导入。

方法二：语义对齐指令
输入：“将这三个表格按模型名称列对齐，统一列名为 model_name、latency_ms、energy_joule、accuracy_top1；缺失值填‘N/A’，数值列自动转为 float。”

Agent 会启动 pandas 引擎，识别各表主键列（即使名称不同，如“arch”“model_id”“net_name”），执行模糊匹配与列映射，生成一张标准化结构表并保存为 merged_data.parquet。

注意：原始 Excel 文件不会被修改，所有操作均在内存中完成，输出文件默认存入 ./hermes-output/ 子目录，确保数据安全。

一键生成符合目标期刊规范的参考文献列表

第一步：确认当前工作区已加载全部 PDF 解析结果。运行 hermes memory list --type citation，检查是否返回 27 条以上带 DOI 字段的记录。

第二步：指定格式模板。输入：“导出参考文献列表，格式为 NeurIPS 2026 官方 LaTeX 样式，按第一作者姓氏字母序排列，保留所有作者（不缩写为 et al.）。”

第三步：注入期刊特异性规则。Agent 自动读取 skills/citation/templates/neurips2026.sty 中定义的字段映射逻辑（例如将 arXiv 预印本的 version 字段转为“arXiv:XXXX.XXXXXv#”），并校验每条 DOI 的有效性。

最终生成的 references.bib 文件可直接粘贴至 Overleaf 项目，无需任何手动调整标点或格式，极大简化投稿准备流程。